MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomonas methanica MC09 chromosome

Total Repeats: 97526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015572	TAT	2	6	27	32	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015572	CAC	2	6	116	121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981748
3	NC_015572	TTGC	2	8	180	187	0 %	50 %	25 %	25 %	333981748
4	NC_015572	AGC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981748
5	NC_015572	T	7	7	224	230	0 %	100 %	0 %	0 %	333981748
6	NC_015572	A	6	6	300	305	100 %	0 %	0 %	0 %	333981748
7	NC_015572	CAA	2	6	374	379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981748
8	NC_015572	GCT	2	6	432	437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981748
9	NC_015572	ATA	2	6	454	459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981748
10	NC_015572	TTTA	2	8	483	490	25 %	75 %	0 %	0 %	333981748
11	NC_015572	TAC	2	6	651	656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981748
12	NC_015572	CTG	2	6	672	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981748
13	NC_015572	GAC	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981748
14	NC_015572	CAA	2	6	740	745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981748
15	NC_015572	A	6	6	900	905	100 %	0 %	0 %	0 %	333981748
16	NC_015572	TTCC	2	8	964	971	0 %	50 %	0 %	50 %	333981748
17	NC_015572	CGG	2	6	999	1004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981748
18	NC_015572	GTG	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981748
19	NC_015572	ATA	2	6	1108	1113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981748
20	NC_015572	GCAA	2	8	1174	1181	50 %	0 %	25 %	25 %	333981748
21	NC_015572	GGCG	2	8	1266	1273	0 %	0 %	75 %	25 %	333981748
22	NC_015572	CAC	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981748
23	NC_015572	ACG	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981748
24	NC_015572	CA	3	6	1459	1464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015572	CAA	2	6	1468	1473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015572	TAA	2	6	1484	1489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015572	T	6	6	1528	1533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015572	GTA	3	9	1540	1548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015572	AATA	2	8	1551	1558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015572	A	6	6	1558	1563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015572	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
32	NC_015572	TTA	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
33	NC_015572	CAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981749
34	NC_015572	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981749
35	NC_015572	GCC	2	6	1806	1811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981749
36	NC_015572	CCG	2	6	1905	1910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981749
37	NC_015572	ATC	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981749
38	NC_015572	TTG	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981749
39	NC_015572	ACGT	2	8	2019	2026	25 %	25 %	25 %	25 %	333981749
40	NC_015572	TAC	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981749
41	NC_015572	CTG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981749
42	NC_015572	TGG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981749
43	NC_015572	GC	3	6	2144	2149	0 %	0 %	50 %	50 %	333981749
44	NC_015572	ATT	2	6	2150	2155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
45	NC_015572	GAC	2	6	2195	2200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981749
46	NC_015572	CAA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981749
47	NC_015572	TTA	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981749
48	NC_015572	GTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981749
49	NC_015572	TCAA	2	8	2316	2323	50 %	25 %	0 %	25 %	333981749
50	NC_015572	TGG	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981749
51	NC_015572	GAA	3	9	2480	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981749
52	NC_015572	CAG	2	6	2605	2610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981749
53	NC_015572	TTG	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981750
54	NC_015572	TTTTA	2	10	2812	2821	20 %	80 %	0 %	0 %	333981750
55	NC_015572	TTG	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981750
56	NC_015572	CAT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981750
57	NC_015572	TTAT	2	8	3007	3014	25 %	75 %	0 %	0 %	333981750
58	NC_015572	CCG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981750
59	NC_015572	ACA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981750
60	NC_015572	CAAAC	2	10	3185	3194	60 %	0 %	0 %	40 %	333981750
61	NC_015572	TGG	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981750
62	NC_015572	TACA	2	8	3260	3267	50 %	25 %	0 %	25 %	333981750
63	NC_015572	GCT	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981750
64	NC_015572	GCCA	2	8	3296	3303	25 %	0 %	25 %	50 %	333981750
65	NC_015572	T	6	6	3304	3309	0 %	100 %	0 %	0 %	333981750
66	NC_015572	ATT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981750
67	NC_015572	CG	3	6	3486	3491	0 %	0 %	50 %	50 %	333981750
68	NC_015572	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981750
69	NC_015572	TGC	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981750
70	NC_015572	CTG	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981750
71	NC_015572	TGG	2	6	3576	3581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981750
72	NC_015572	TAA	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981750
73	NC_015572	GTTT	2	8	3795	3802	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015572	GCG	2	6	3828	3833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015572	ACA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015572	CGA	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
77	NC_015572	TCCGTA	2	12	4071	4082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333981751
78	NC_015572	AGA	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
79	NC_015572	TGC	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981751
80	NC_015572	CGG	2	6	4169	4174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
81	NC_015572	CGA	2	6	4181	4186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
82	NC_015572	CGG	2	6	4205	4210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
83	NC_015572	CGG	2	6	4318	4323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
84	NC_015572	AAG	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
85	NC_015572	TTCGAA	2	12	4512	4523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333981751
86	NC_015572	GGC	2	6	4524	4529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
87	NC_015572	AAAAC	2	10	4558	4567	80 %	0 %	0 %	20 %	333981751
88	NC_015572	AAG	2	6	4606	4611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
89	NC_015572	CAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
90	NC_015572	CGG	2	6	4697	4702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981751
91	NC_015572	AGC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
92	NC_015572	A	6	6	4776	4781	100 %	0 %	0 %	0 %	333981751
93	NC_015572	ACC	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
94	NC_015572	CGA	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
95	NC_015572	TTC	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981751
96	NC_015572	TCG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981751
97	NC_015572	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981751
98	NC_015572	CCA	2	6	4918	4923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
99	NC_015572	AAC	2	6	4954	4959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
100	NC_015572	CAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
101	NC_015572	GCC	2	6	4998	5003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
102	NC_015572	CG	3	6	5018	5023	0 %	0 %	50 %	50 %	333981751
103	NC_015572	CCCTG	2	10	5108	5117	0 %	20 %	20 %	60 %	333981751
104	NC_015572	CGGC	2	8	5146	5153	0 %	0 %	50 %	50 %	333981751
105	NC_015572	CCG	2	6	5177	5182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
106	NC_015572	GAA	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981751
107	NC_015572	ACA	2	6	5314	5319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333981751
108	NC_015572	CAT	4	12	5342	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981751
109	NC_015572	TCT	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981751
110	NC_015572	GCC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
111	NC_015572	A	6	6	5478	5483	100 %	0 %	0 %	0 %	333981751
112	NC_015572	TAAT	2	8	5644	5651	50 %	50 %	0 %	0 %	333981751
113	NC_015572	GCC	2	6	5702	5707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
114	NC_015572	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
115	NC_015572	CAC	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
116	NC_015572	A	6	6	5923	5928	100 %	0 %	0 %	0 %	333981751
117	NC_015572	AGCA	2	8	5998	6005	50 %	0 %	25 %	25 %	333981751
118	NC_015572	AGG	2	6	6019	6024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981751
119	NC_015572	GAT	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981751
120	NC_015572	A	6	6	6051	6056	100 %	0 %	0 %	0 %	333981751
121	NC_015572	AGC	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
122	NC_015572	ACC	2	6	6117	6122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981751
123	NC_015572	GCC	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333981751
124	NC_015572	TGC	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981751
125	NC_015572	CGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981751
126	NC_015572	TAC	2	6	6191	6196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981751
127	NC_015572	GTT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981751
128	NC_015572	A	6	6	6336	6341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015572	CTA	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015572	A	7	7	6390	6396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015572	TGGATT	2	12	6430	6441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015572	AAC	2	6	6458	6463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015572	AAAATC	2	12	6477	6488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015572	TTG	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015572	T	6	6	6620	6625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015572	CTTA	2	8	6632	6639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015572	CAA	2	6	6643	6648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015572	GCGAT	2	10	6711	6720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015572	ATGA	2	8	6791	6798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015572	AAG	2	6	6844	6849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015572	GTT	2	6	6939	6944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015572	AC	5	10	7105	7114	50 %	0 %	0 %	50 %	333981752
143	NC_015572	CTG	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981752
144	NC_015572	A	6	6	7222	7227	100 %	0 %	0 %	0 %	333981752
145	NC_015572	TGG	2	6	7320	7325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981752
146	NC_015572	ATAA	2	8	7463	7470	75 %	25 %	0 %	0 %	333981752
147	NC_015572	ATG	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981752
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152	NC_015572	ATCT	2	8	7706	7713	25 %	50 %	0 %	25 %	333981752
153	NC_015572	CGA	2	6	7755	7760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981752
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155	NC_015572	GAAATT	2	12	7919	7930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333981752
156	NC_015572	GAT	2	6	7944	7949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981752
157	NC_015572	CTT	2	6	7999	8004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333981753
158	NC_015572	TATT	2	8	8063	8070	25 %	75 %	0 %	0 %	333981753
159	NC_015572	TTGA	2	8	8095	8102	25 %	50 %	25 %	0 %	333981753
160	NC_015572	GAA	2	6	8140	8145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981753
161	NC_015572	GTT	2	6	8164	8169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333981753
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163	NC_015572	GAC	2	6	8184	8189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981753
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167	NC_015572	TAT	2	6	8454	8459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981753
168	NC_015572	AATC	2	8	8474	8481	50 %	25 %	0 %	25 %	333981753
169	NC_015572	A	6	6	8492	8497	100 %	0 %	0 %	0 %	333981753
170	NC_015572	ATT	2	6	8515	8520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981753
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172	NC_015572	T	8	8	8555	8562	0 %	100 %	0 %	0 %	333981753
173	NC_015572	GAT	2	6	8659	8664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981753
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175	NC_015572	GAT	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981753
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179	NC_015572	A	7	7	8849	8855	100 %	0 %	0 %	0 %	333981753
180	NC_015572	A	6	6	8944	8949	100 %	0 %	0 %	0 %	333981753
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197	NC_015572	GTT	2	6	9831	9836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_015572	GAA	2	6	10008	10013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_015572	CAA	2	6	12037	12042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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235	NC_015572	ATT	2	6	12150	12155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_015572	A	6	6	12160	12165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_015572	CGT	2	6	14231	14236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981759
270	NC_015572	AGG	2	6	14294	14299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333981759
271	NC_015572	ACTG	2	8	14445	14452	25 %	25 %	25 %	25 %	333981759
272	NC_015572	TGAT	2	8	14456	14463	25 %	50 %	25 %	0 %	333981759
273	NC_015572	GCT	2	6	14518	14523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981759
274	NC_015572	GCCAT	2	10	14540	14549	20 %	20 %	20 %	40 %	333981759
275	NC_015572	A	6	6	14557	14562	100 %	0 %	0 %	0 %	333981759
276	NC_015572	TAA	2	6	14576	14581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981759
277	NC_015572	A	6	6	14627	14632	100 %	0 %	0 %	0 %	333981759
278	NC_015572	G	6	6	14825	14830	0 %	0 %	100 %	0 %	333981759
279	NC_015572	GGC	2	6	14847	14852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981759
280	NC_015572	TTA	2	6	14854	14859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981759
281	NC_015572	GGT	2	6	14895	14900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981759
282	NC_015572	ACG	2	6	15053	15058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981759
283	NC_015572	CGA	2	6	15090	15095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981759
284	NC_015572	CAT	2	6	15105	15110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981759
285	NC_015572	CGT	2	6	15112	15117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333981759
286	NC_015572	GTA	2	6	15142	15147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981759
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288	NC_015572	GGC	2	6	15297	15302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333981759
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293	NC_015572	GA	3	6	15702	15707	50 %	0 %	50 %	0 %	333981760
294	NC_015572	CAT	2	6	15719	15724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333981760
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301	NC_015572	TGG	2	6	16038	16043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981760
302	NC_015572	CCCT	2	8	16394	16401	0 %	25 %	0 %	75 %	333981760
303	NC_015572	TGG	2	6	16430	16435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333981760
304	NC_015572	TTAT	2	8	16623	16630	25 %	75 %	0 %	0 %	333981761
305	NC_015572	CCA	2	6	16720	16725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333981761
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311	NC_015572	GAT	2	6	17110	17115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981761
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313	NC_015572	CAG	2	6	17254	17259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333981761
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354	NC_015572	TGT	2	6	19843	19848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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356	NC_015572	GT	3	6	19983	19988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
357	NC_015572	TTA	2	6	19989	19994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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363	NC_015572	TTAT	2	8	20405	20412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
364	NC_015572	AGC	2	6	20431	20436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
365	NC_015572	ACA	2	6	20466	20471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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382	NC_015572	ATT	2	6	21360	21365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333981764
383	NC_015572	TAG	2	6	21550	21555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333981764
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392	NC_015572	AT	3	6	21873	21878	50 %	50 %	0 %	0 %	333981764
393	NC_015572	A	6	6	21898	21903	100 %	0 %	0 %	0 %	333981764
394	NC_015572	ATTT	2	8	21912	21919	25 %	75 %	0 %	0 %	333981764
395	NC_015572	GAA	2	6	21936	21941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333981764
396	NC_015572	ATA	2	6	21978	21983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981764
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398	NC_015572	AAT	2	6	22047	22052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333981764
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